В 1990-х годах широко развернулась электрификация железнодорожных путей на Северо-Западе России, в которой «Ленгипротранс» принимал активное участие. Работы были начаты с проектирования участка Волховстрой — Свирь Октябрьской железной дороги. Это стало новым этапом для электрификации направления на Мурманск.
Поначалу главным инженером проекта являлся А.Б. Сарычев, а с 1996 года — Г.В. Матвеев. Особую ответственность на специалистов налагало то, что строительство велось практически с «листа» по сигнальным экземплярам рабочих чертежей.
В 1990-х годах широко развернулась электрификация железнодорожных путей на Северо-Западе России, в которой «Ленгипротранс» принимал активное участие. В рамках этих работ был электрифицирован участок Идель — Беломорск на переменном токе.
В ходе работ были запроектированы две тяговые подстанции, продольная контактная сеть, СЦБ, электроснабжение.
В 1990-х годах широко развернулась электрификация железнодорожных путей на Северо-Западе России, в которой «Ленгипротранс» принимал активное участие. На завершающем этапе электрификации Северного направления был запроектирован участок Идель — Свирь на переменном токе 27,5 кВ. Это стал завершающий участок электрификации направления Санкт-Петербург — Мурманск Октябрьской железной дороги.
Бабаево — внеклассная железнодорожная станция на линии Вологда — Санкт-Петербург Октябрьской железной дороги. По характеру работы станция является участковой, а по объему и сложности — внеклассной. В 1990-2000 годы «Ленгипротранс» в несколько этапов разработал проект реконструкции станции в виду увеличения транзитного грузового движения по линии Волховстрой — Кошта.
В 1960-х годах «Ленгипротранс» разработал проект железнодорожного вокзала в Архангельске. Здание расположено в центре города на станции Архангельск-Город Северной железной дороги.
Сооружение было запроектирован на правом берегу реки Северная Двина, в непосредственной близости от города. Такая возможность появилась в связи со строительством железнодорожного перехода через реку от станции Исакогорки до Архангельска, проект которого также был выполнен «Ленгипротрансом».
Автодорожный мост был спроектирован и построен в 1960-х годах и расположен на 1198 км автомобильной дороги Ленинград — Мурманск (современное название Р-21 «Кола»).
До строительства автомобильной дороги Ленинград — Мурманск на участке Кандалакша — Мурманск Бабинская Имандра и Иокостровская Имандра соединялись двумя протоками — Большая и Узкая Салма. При строительстве моста протока Узкая Салма была пересыпана насыпью. Ширина протоки Большая Салма до строительства автодороги составляла около 400 м, после строительства моста сужена подходными насыпями до 70 м.
В начале 1980-х годов «Ленгипротранс» разработал проект железнодорожного моста через реку Волхов в Волховском районе Ленинградской области. Сооружение было запроектировано в рамках строительства вторых путей линии Волховстрой — Кошта, входящей в Петербурго-Вологодскую железную дорогу. Проект был обусловлен перспективой увеличения грузопотока между Санкт-Петербургом и промышленными регионами Северо-Запада России.
В советский период «Ленгипротранс» активно участвовал в проектировании транспортной инфраструктуры в Прибалтике. Во многом это было связано с развитием подходов к портам в Балтийском море. В столице Литвы — Вильнюсе институтом было запроектировано наибольшее количество путепроводов.
В советский период «Ленгипротранс» активно участвовал в транспортном развитии железнодорожных подходов и станций у морских портов в Прибалтике. Для развития станции Вентспилс институтом была спроектирована путепроводная развязка в железнодорожном парке, находящемся в районе Вентспилсского порта.
Вентспилс — внеклассная железнодорожная станция линии Вентспилс — Тукумс II в одноименном городе Латвии. Была открыта в 1901 году с первоначальным названием Виндава. На станции осуществляется транзит грузов из морского порта на железную дорогу.
Железнодорожный мост через реку Юрибей — самый длинный мостовой переход за Полярным Кругом. Сооружение находится на железнодорожной линии Обская — Бованенково, проект которой разработал «Ленгипротранс» в 1980-е годы для освоения Бованенковского и Харасавэйского нефтегазовых месторождений. В связи с экономическим кризисом конца 1980-х годов темпы строительства существенно снизились. В 2004 году было принято решение о возобновлении строительства, в рамках которого был возведен мост через реку Юрибей.